El hipotálamo, es otra pequeña parte del diencefalo que se considera de las regiones mas importantes en lo que es la regulación y coordinación de conductas esenciales vinculadas al mantenimiento de la especie.
Esta ampliamente relacionado con el sistema limbico y muchas de sus funciones se han mantenido casi intactas durante la evolución del ser humano, tales como el hambre la sed y el deseo o apetito sexual para la reproducción.
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